真空冷凍干燥機按系統(tǒng)分，由致冷系統(tǒng)、真空系統(tǒng)、加熱系統(tǒng)、和控制系統(tǒng)四個主要部分組成。按結構分，由凍干箱或稱干燥箱、冷凝器或稱水汽凝集器、冷凍機、真空泵和閥門、電氣控制元件等組成。

凍干箱是一個能夠致冷到-40℃左右，能夠加熱到+50℃左右的高低溫箱，也是一個能抽成真空的密閉容器。它是真空冷凍干燥機的主要部分，需要凍干的產(chǎn)品就放在箱內分層的金屬板層上，對產(chǎn)品進行冷凍，并在真空下加溫，使產(chǎn)品內的水份升華而干燥。
  冷凝器同樣是一個真空密閉容器，在它的內部有一個較大表面積的金屬吸附面，吸附面的溫度能降到-40℃以下，并且能恒定地維持這個低溫。冷凝器的功用是把凍干箱內產(chǎn)品升華出來的水蒸氣凍結吸附在其金屬表面上。
  凍干箱、冷凝器、真空管道和閥門，再加上真空泵，便構成真空冷凍干燥機的真空系統(tǒng)。真空系統(tǒng)要求沒有漏氣現(xiàn)象，真空泵是真空系統(tǒng)建立真空的重要部件。真空系統(tǒng)對于產(chǎn)品的迅速升華干燥是*的。

  制冷系統(tǒng)由冷凍機與凍干箱、冷凝器內部的管道等組成。冷凍機可以是互相獨立的二套，也可以合用一套。冷凍機的功用是對凍干箱和冷凝器進行致冷，以產(chǎn)生和維持它們工作時所需要的低溫，它有直接致冷和間接致冷二種方式。
  加熱系統(tǒng)對于不同的真空冷凍干燥機有不同的加熱方式。有的是利用直接電加熱法；有的則利用中間介質來進行加熱，由一臺泵使中間介質不斷循環(huán)。加熱系統(tǒng)的作用是對凍干箱內的產(chǎn)品進行加熱，以使產(chǎn)品內的水份不斷升華，并達到規(guī)定的殘余水份要求。
  控制系統(tǒng)由各種控制開關，指示調節(jié)儀表及一些自動裝置等組成，它可以較為簡單，也可以很復雜。一般自動化程度較高的真空冷凍干燥機則控制系統(tǒng)較為復雜。控制系統(tǒng)的功用是對真空冷凍干燥機進行手動或自動控制，操縱機器正常運轉，以凍干出合乎要求的產(chǎn)品來。

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